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ESMFold2
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除结构预测外,这次还同时给出 68 亿蛋白与 11 亿结构的 atlas,并展示了面向 5 个治疗靶点的实验验证,适合关注蛋白设计和计算生物学交叉方向的人直接点开原文。核心解读
Roshan Rao 转发并由 Alex Rives 正式公布 ESMFold2,一个新的蛋白结构预测模型,可从单序列或 MSA 预测结构,在蛋白-蛋白相互作用基准上达到 SOTA,尤其擅长抗体-抗原复合物预测。团队还展示了在癌症和免疫学相关的 5 个治疗靶点上设计并验证 miniprotein binders 和单链抗体,称获得了很高成功率,且亲和力达到与治疗活性一致的水平。同步发布了包含 68 亿蛋白和 11 亿个预测结构的 atlas;模型建立在训练自数十亿蛋白序列的语言模型之上,并可用基于梯度的搜索发现高亲和力蛋白结合体。